Για τη φοίτηση στο ΠΜΣ καταβάλλονται τέλη φοίτησης ύψους 2.900 ευρώ. Η καταβολή των τελών φοίτησης γίνεται σε τρείς δόσεις: η 1η δόση με την εγγραφή, η 2η δόση με την ολοκλήρωση του α’ εξαμήνου και η 3η δόση με την ολοκλήρωση του β’ εξαμήνου, η οποία αποτελεί και προϋπόθεση για την ανάληψη διπλωματικής εργασίας. Οι καταβολές γίνονται σε τραπεζικό λογαριασμό του Ειδικού Λογαριασμού Κονδυλίων και Έρευνας (ΕΚΛΕ) του Πανεπιστημίου Δυτικής Μακεδονίας.
Πέραν του αριθμού των σπουδαστών που θα πληρώσουν τέλη φοίτησης, θα υπάρξει και ένα ποσοστό που θα φοιτήσουν δωρεάν σύμφωνα με τα οριζόμενα στο νόμο 4957/2022.
Το ΠΜΣ δύναται να χορηγεί υποτροφίες σε μεταπτυχιακούς/ες φοιτητές/τριες, βάσει ακαδημαϊκών κριτηρίων αριστείας καθώς και ανταποδοτικές υποτροφίες σύμφωνα με την ισχύουσα νομοθεσία και όσα ειδικότερα ορίζονται στον Κανονισμό Μεταπτυχιακών Σπουδών.